IFCD007PO bioinformática aplicada al desarrollo de medicamentos

1. INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA.

• Intentando definir la bioinformática.
• Relevancia actual de la bioinformática.
• Formatos de ficheros y bases de datos.
• Proveedores institucionales de datos.
• Herramientas locales y de internet.

2. HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES.

• Sistemas operativos alternativos: introducción a Unix/Linux.
• Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes).
• Lenguajes de programación: Perl como ejemplo.
• Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl.
• Herramientas estadísticas: R como ejemplo.
• Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo.
• Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo.
• Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos.

3. ALGORITMOS.

• Búsqueda de patrones en secuencias.
• Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica.
• Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal.

4. BIOINFORMÁTICA APLICADA.

• Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST).
• Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones).
• Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR).
• Minería en datos masivos (high throughput screening).
• Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO).
• Análisis de la variación (polimorfismos).
• Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias).
• Biología estructural tridimensional: PDB.